2006年，上海同济大学教育发展基金会在上海市民政局登记注册，成为具有独立法人的非营利性社会组织。学校授权基金会为校内外社会捐赠的管理机构，学校接受的所有社会捐赠由基金会进行统一管理。基金会办公地点设在同济大学内，为非公募基金会，其宗旨是接受同济大学校友及社会各界捐赠，支持本市高等院校改善教学、科研和公共设施，扶植重点课程、重点学科和实验室建设，奖励优秀教职工和品学兼优的在校学生，资助优秀教师和学生出国深造，开展国际、国内学术交流，支持和发展教育有关的其它各类项目。在同济大学的新百年征程上，基金会将与社会各界的捐资单位和个人一道，同舟共济，继往开来，携手共创美好的明天。